ls /data/popgen_course

head -20 /data/popgen_course/genotypes_small.ind

head -20 /data/popgen_course/genotypes_small.snp

head -20 /data/popgen_course/genotypes_small.geno | cut -c1-50

wc -l /data/popgen_course/genotypes_small.ind
wc -l /data/popgen_course/genotypes_small.snp

head -1 /data/popgen_course/genotypes_small.geno | wc -c

wc -l /data/popgen_course/genotypes_small.geno

awk '{print $3}' /data/popgen_course/genotypes_small.ind | sort | uniq -c | head -20

cat pca.WestEurasia.params.txt

cat pca.AllEurasia.params.txt